Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P06335 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06335 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06335 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06335 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06335 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P06335 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P06335 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms