Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06321 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06321 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06321 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06321 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06321 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06321 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06321 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms