Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms