Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CfdP03953 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CfdP03953 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CfdP03953 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CfdP03953 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CfdP03953 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CfdP03953 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CfdP03953 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CfdP03953 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CfdP03953 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms