Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa7P02830 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa7P02830 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms