Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Ab1P01921 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms