Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ighg1P01869 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ighg1P01869 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ighg1P01869 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ighg1P01869 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ighg1P01869 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms