Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01822 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01822 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01822 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01822 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01822 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01822 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01822 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01822 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms