Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01798 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01798 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01798 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01798 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01798 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms