Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01746 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01746 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01746 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01746 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01746 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01746 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01746 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01746 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01746 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms