Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01641 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01641 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01641 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01641 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01641 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01641 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01641 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01641 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01641 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01641 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms