Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms