Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ccl20O89093 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms