Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setdb1O88974 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms