Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apaf1O88879 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms