Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl6O88848 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl6O88848 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms