Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tom1O88746 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tom1O88746 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms