Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms