Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cops6O88545 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops6O88545 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms