Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms