Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkcO88445 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AurkcO88445 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms