Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nid2O88322 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nid2O88322 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nid2O88322 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nid2O88322 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nid2O88322 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nid2O88322 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms