Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm6aO70546 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm6aO70546 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms