Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb5O70309 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb5O70309 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms