Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top3aO70157 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms