Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alx3O70137 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms