Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtogO55225 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtogO55225 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtogO55225 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
OtogO55225 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
OtogO55225 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
OtogO55225 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtogO55225 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms