Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt5hO55201 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt5hO55201 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms