Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx4O55187 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.1 ms