Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms