Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35aO55142 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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