Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sept7O55131 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sept7O55131 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sept7O55131 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms