Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap1O55125 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms