Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg2O55111 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms