Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc3O55013 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc3O55013 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc3O55013 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms