Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SlkO54988 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SlkO54988 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SlkO54988 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SlkO54988 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SlkO54988 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SlkO54988 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms