Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf13O54965 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf13O54965 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf13O54965 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms