Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb3O54890 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itgb3O54890 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3O54890 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3O54890 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms