Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DffbO54788 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DffbO54788 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DffbO54788 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffbO54788 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffbO54788 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms