Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DffaO54786 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DffaO54786 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DffaO54786 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DffaO54786 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DffaO54786 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DffaO54786 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DffaO54786 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DffaO54786 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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