Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab33bO35963 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms