Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bnc1O35914 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnc1O35914 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms