Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm2O35900 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm2O35900 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms