Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Socs1O35716 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs1O35716 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms