Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnnO35691 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnnO35691 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PnnO35691 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnnO35691 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PnnO35691 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PnnO35691 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PnnO35691 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnnO35691 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PnnO35691 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnnO35691 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PnnO35691 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms