Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn1mwO35599 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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