Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sema6aO35464 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms