Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih1O35372 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnih1O35372 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms