Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2O35245 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2O35245 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2O35245 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms