Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nedd9O35177 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms